Реабилитацию детей со спина бифида рекомендуется начинать сразу же после рождения. Рекомендуется физиотерапия и лечебная гимнастика, направленная, в первую очередь, на восстановление подвижности конечностей и профилактику их деформаций. Интенсивные физические упражнения и физиотерапевтические процедуры в ряде случаев помогают предотвратить развитие контрактур и укорочение конечностей, однако для коррекции тяжелых дефектов в дальнейшем потребуется хирургическое лечение.

Из-за того, что при спина бифида также поражаются корешки спинномозговых нервов, паралич нижних конечностей часто сочетается мышечным гипотонусом. В таких случаях, помимо физиотерапии, ребенку понадобится поддерживающий корсет, который обеспечит ему возможность сидеть без посторонней помощи, сохраняя при этом равновесие. Ношение корсета рекомендуется начинать в раннем возрасте, когда младенец, согласно принятым нормам, начинает проводить большую часть времени в положении сидя, а не лежа.

Ортопедический корсет также служит для профилактики сколиоза и кифоза. С этой же целью, чтобы помочь нормальному формированию позвоночника, детей обучают пользоваться устройствами, закрепляющими тело в вертикальном положении и позволяющими стоять. На более позднем этапе можно перейти к использованию «ходунков» или инвалидного кресла. В конечном итоге, способность ребенка к самостоятельному передвижению определяется несколькими факторами:

• степенью поражения спинного мозга
• когнитивными способностями
• готовностью ребенка и членов его семьи к регулярным занятиям и физическим упражнениям
• адаптацией среды (детского сада, школы и т.д.) к особым потребностям ребенка

Детям с нарушенными функциями верхних конечностей понадобится более сложная реабилитация. В частности, из-за невозможности писать или печать, их потребуется обучать альтернативным навыкам коммуникации.

У значительной части детей со спина бифида наблюдается также дефицит концентрации и внимания, нарушения памяти и другие когнитивные расстройства. В таких ситуациях рекомендуется помощь психолога, медикаментозная терапия и интеграция в системе образования, подходящей для детей с ограниченными возможностями.

Из-за нарушений иннервации мочевого пузыря дети со спина бифида могут страдать от недержания мочи или от проблем с недостаточным опорожнением мочевого пузыря. Им требуется наблюдение уролога, а также обучение различным техникам, позволяющим контролировать мочеиспускание. Например, для этой цели выполняются регулярные катетеризации: в раннем возрасте их производят родители, а затем ребенка можно научить делать их самостоятельно. Аналогичным образом – при помощи очистительных клизм и приема слабительных препаратов при необходимости – нормализуют деятельность кишечника.

В целом, реабилитация детей со спина бифида представляет собой длительный и комплексный процесс, в котором задействованы педиатры, хирурги, ортопеды, физиотерапевты и специалисты по лечебной физкультуре, урологи и гастроэнтерологи, психологи и педагоги.

В Израиле план реабилитации для ребенка со спина бифида составляют индивидуально. Программа реабилитации во многом зависит от того, какое хирургическое лечение получил ребенок и насколько успешным были его результаты. Несмотря на то, что хирургическая операция не способна компенсировать анатомические дефекты спинного мозга, она предотвращает развитие осложнений и может в значительной степени уменьшить тяжесть сопутствующих аномалий, облегчая реабилитацию детей со спина бифида. Наиболее известным израильским специалистом по хирургическому лечению спина бифида является профессор Шимон Рохкинд – автор экспериментальных методик по  восстановлению спинного мозга и периферических нервов.